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新免氏は赤松氏の配下であったというが、貞重の子宗貞の代には衰退の色を隠せなくなった赤松氏から離れ、備前浦上氏についていた。
同時代には尼子氏が美作へと勢力を伸ばし始め、天文21年（1552年）尼子晴久が出雲など8カ国の守護となった中に美作が含まれていたことから、尼子氏が本格的に美作へ進出を始める。
これに対し、新免氏をはじめとする吉野郡の国人は尼子氏に抵抗、結果、天文23年（1554年）尼子氏の攻撃によって新免氏は竹山城から追われてしまう。
しかし、毛利氏の攻勢により尼子氏の勢力が衰えると、美作は再度浦上氏の勢力圏となった後、これにかわった宇喜多氏の支配下に入る。
新免氏も宗貞の子宗貫が宇喜多直家に従って戦功を上げたことでようやく吉野郡に復帰。
その後は宇喜多家臣として活動を続けたが、関ヶ原の戦いによって宇喜多氏が没落すると、新免氏も吉野郡の所領を失うこととなった。
この時竹山城は廃城となり、新免氏は黒田氏の招きを受け九州に渡り、以降黒田家臣として続いた。

山頂付近の主郭部分は無線設備等の建築により大きく改変を受けたため、めぼしい遺構に乏しく、そこから西に離れた坊主ヶ丸と呼ばれる一帯に曲輪の痕跡が確認できる程度である。